長崎市南山手町にある。長崎における観光のメッカである・・・。江戸時代末期、大浦天主堂は居留地在留外国人（専用）のための教会として許可された。
この天主堂を建てるため、文久２年（１８６２）１１月フランス人神父フューレ、プチジャン両師が横浜に到着し、翌年文久３年１月１２日にフューレ師は長崎に到着し、その後１ヶ月後の２月１４日に着工された。
途中、フューレ師はフランスへ帰国し、プチジャン神父を中心に１１月には新たにローカーニュ神父がこれを助け、元治元年（１８６４）１２月２９日に完成し、翌元治２年２月１９日に江戸からジラール日本教区長を迎えて、献堂式が行われた。
日本で現存する最古の天主堂である。（国宝）設計監理はプチジャン神父が行ったと考えられ、施工した大工の棟梁は小山秀（天草）、その下に大渡伊勢吉（伊王島）、溝口市蔵（浦上村）、川原久米吉（外海村）らがいたという。
当時創建された天主堂（教会）は現在の大浦天主堂と異なり、木造で、３つの尖頭があり、現在の中央尖頭（鐘楼）のみが一致し、外見は全く異なる。また、中央にバラ窓があり、尖頭アーチ窓（入口）と両側に小さな尖頭アーチ窓が見え、全体的にはゴシック様式でまとめられていたようである。
更に中央に右書きで「堂主天」と書かれており、非常に興味深い。
明治６年に切支丹解放令が出されると、礼拝に来る日本人が増加し、改修する必要が生じ、ボワリエ神父指導のもと、大工棟梁の丸山佐吉（天草）、大工の溝口市蔵（浦上村）らによって大改修され、明治１２年５月２２日にプチジャン司教により献堂された。この大改修は、創建天主堂を中核として、主祭壇を奥深く拡張し、両側の側廊を更に両側に延長し、玄関部分を拡張し、面積が倍近く拡張されている。また構造も木造から煉瓦造となった。
概要を示すと、煉瓦造、屋根は重層構成、平面形式は五廊式（創建の三廊式を拡張、県下で唯一）、内部立面は三層構成、天井はリブ・ヴォールト天井（コウモリ天井）、内部列柱は円柱と四角柱、両開きの尖頭アーチ、床は板敷きとなっている。日本で一番有名な天主堂であり、これ以上の説明は不要と思われる。
