Characterization of wild Prunus yedoensis analyzed by inter-simple sequence repeat and chloroplast DNA
引用文献:Scientia_Horticulturae, 114(2):121-128 (2007).

Mark S. Roha, Eun Ju Cheongb, Ik-Young Choic and Young Hee Joungd
aUS Department of Agriculture, Agricultural Research Service, National Arboretum, Floral and Nursery Plants Research Unit, Beltsville, MD 20705, USA
bUS Department of Agriculture, Agricultural Research Service, National Germplasm Resources Laboratory, Plant Disease Research Unit, Beltsville, MD 20705, USA
cSeoul National University, CALS, NICEM, San 56-1 Sillim-9-dong Gwanak-gu, Seoul 151-921, Republic of Korea
dCheonnam National University, School of Biological Science and Technology, Gwangju 500-757, Republic of Korea
 This study was initiated to attempt clarify the identities of taxa referred to as Prunus yedoensis that grows under natural environments in Jeju, Korea and of Yoshino cherry hybrids of cultivated origin (also recorded as P. × yedoensis) in Japan, and to understand the difference between these two taxa. P. yedoensis and other species collected from natural habitats from Jeju, Korea and cultivated materials of Yoshino cherries from Tokyo and Washington, DC. were analyzed with inter-simple sequence repeat (ISSR) markers, and sequence analysis of two chloroplast DNA (cpDNA) genes, rpl16 and trnL-trnF spacer. Depending on the source of Yoshino cherry, accessions show variations with ISSR and cpDNA. Accessions belonging to each of P. serrulata var. spontanea, P. serrulata var. pubescens, and P. sargentii were grouped closely to P. yedoensis and Yoshino cherry accessions. However, two Yoshino cherry accessions that include ‘Akebono’ showed the same rpl16 haplotype of A and A at the position of 113 and 206, respectively, which were found in 4 out of 16 P. yedoensis accessions. Twelve accessions of P. yedoensis and 11 other Yoshino cherries showed rpl16 haplotype of T and A at these positions. P. yedoensis native to Korea can be considered different from Yoshino cherry of hybrid origin from Japan based on ISSR markers and rpl16 haplotypes. Therefore, it may be concluded that the Korean taxon currently referred to as P. yedoensis can be considered indigenous and sufficiently distinct to warrant recognition as a distinct entity.
 本研究は、韓国済州島の自然環境の下で生育するPrunus yedoensisと称される分類群と、日本の栽培起源であるソメイヨシノ分類群(P.× yedoensisとも表記される)との正体を明らかにするために、開始したものである。韓国済州島の自然生態から採集されたP. yedoensisとその他の種、および東京とワシントンDCから採集されたソメイヨシノの栽培品を、ISSR (inter-simple sequence repeat)マーカーおよびchloroplast DNA(cpDNA)遺伝子であるrpl16と trnL-trnFスペーサーの連続分析で解析した。 ソメイヨシノのソースによってはISSRとcpDNA遺伝子のアクセッションに変異が見られた。P. serrulata var. spontanea(ヤマザクラ)、P. serrulata var. pubescens(カスミザクラ)とP sargentii(オオヤマザクラ)のそれぞれに属するアクセッションはP. yedoensisおよびソメイヨシノのアクセッションと緊密なグループであることがわかった。 しかしながら、アケボノ(曙)を含む2つのソメイヨシノのアクセッションは、それぞれ113と206のポジションにおいて、同じAのrpl16ハロタイプおよびAを示し、16あるP. yedoensisアクセッションのうちの4つに見られた。P. yedoensisの残りの12のアクセッションおよびその他の11種のソメイヨシノはこのポジションでTとAのrpl16ハロタイプを示した。韓国原産のP. yedoensisは、 ISSR マーカーおよびrpl16 ハロタイプに基づけば、日本の交配種起源のソメイヨシノとは異なると考えられる。 したがって、一般にP. yedoensisと称される韓国の分類群は(韓国に)固有であり、別種として認識するに足ると考えられる。